發(fā)布時(shí)間:2023-08-28 16:38:12 人氣:368 來(lái)源:析浦(上海)科學(xué)儀器
假設(shè)你剛剛做了一個(gè)PCR反應(yīng),復(fù)制了許多目標(biāo)DNA?;蛘吣阋呀?jīng)做了一些DNA克隆,試圖將基因復(fù)制到圓形DNA質(zhì)粒中?,F(xiàn)在,你想檢查你的PCR是否有效,或者你的質(zhì)粒中是否有正確的基因。如何直接觀察DNA片段?
凝膠電泳(gel electrophoresis)是一個(gè)好選擇!凝膠電泳是一種電泳形式,在分子生物學(xué)中常用于核酸(DNA/RNA)分子的分離、純化和鑒定。凝膠電泳是一種用于根據(jù)DNA/RNA分子大小和電荷分離DNA/RNA片段的技術(shù)。根據(jù)分子的大小和電荷,分子將以不同的方向或不同的速度穿過(guò)凝膠,從而使它們相互分離。
所有的DNA分子每單位質(zhì)量都有相同的電荷量。所以,DNA片段的大小決定了它們的移動(dòng)速度。通過(guò)凝膠電泳實(shí)驗(yàn),我們可以直接觀察到樣本中存在多少不同的DNA片段,以及它們相對(duì)于彼此的大小。我們還可以把已知大小的DNA片段當(dāng)成“標(biāo)尺”在一旁,來(lái)確定一段DNA的大小。
用于DNA分離的凝膠通常由一種名為瓊脂糖的多糖制成,這種多糖呈干燥的粉末狀薄片。
瓊脂Agar是從紅藻中獲得的凝膠狀物質(zhì),從中進(jìn)一步純化得到瓊脂糖。瓊脂糖不帶電荷,具有親水性,對(duì)敏感的生物大分子極少引起變性和吸附,是理想的惰性載體。常在生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)室中,作為電泳、層析等技術(shù)中的半固體支持物,用于分子的分離和分析。
瓊脂糖在凝膠中的百分比影響了孔隙的大小,從而影響了可能通過(guò)的分子的大小以及通過(guò)的速度。瓊脂糖的百分比越高,孔徑越小,因此能夠通過(guò)的分子越小,通過(guò)速度越慢。所以,高濃度瓊脂糖用于小分子的分離,低濃度瓊脂糖用于大分子的分離。瓊脂糖凝膠是根據(jù)質(zhì)量體積比來(lái)制備的。1克瓊脂糖和100毫升電泳緩沖液可以制備1%的瓊脂糖凝膠。(1g agarose/100ml buffer = 1% gel)。在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室中,0.7~1%的瓊脂糖凝膠通常用于日常的DNA分離,對(duì)0.2~10kb范圍內(nèi)的片段提供清晰的區(qū)分。
DNA/RNA片段被分離后,我們就可以檢查凝膠上面的條帶。由于DNA肉眼不可見(jiàn),在制備瓊脂糖凝膠時(shí),會(huì)加入溴化乙錠(Ethidium Bromide)進(jìn)行DNA染色。溴化乙錠是一種芳香族化合物,能夠嵌入DNA的相鄰的堿基之間,形成一種絡(luò)合物。把染色后的凝膠放置在析浦紫外透射臺(tái)XEPU-1126上,在紫外線照射下時(shí),DNA片段會(huì)發(fā)出橘黃色的熒光,使我們能夠看到凝膠上不同位置的DNA。
凝膠上一條定義明確的DNA“線”被稱為帶。每條帶都包含大量相同大小的DNA片段,這些片段都作為一個(gè)群體到達(dá)了相同的位置。單個(gè)DNA片段(甚至是一小群DNA片段)在凝膠上是看不見(jiàn)的。通過(guò)將樣本中的條帶與DNA ladder進(jìn)行比較,我們可以確定它們的大致大小。
析浦紫外透射臺(tái)是分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中的常用設(shè)備,主要用于核酸(DNA/RNA)凝膠電泳實(shí)驗(yàn)中的觀測(cè)和切膠。紫外透射臺(tái)也可用于測(cè)定PCR產(chǎn)物的大小、在限制性內(nèi)切酶消化后純化DNA片段、定量DNA或在提取后驗(yàn)證RNA完整性。析浦紫外透射臺(tái)XEPU-1126是您凝膠電泳實(shí)驗(yàn)的好助手!
析浦紫外透射儀XEPU-1126系列可選365nm,302nm或254nm的UV燈管。
均勻透照:優(yōu)質(zhì)紫外燈管提供亮度均勻、強(qiáng)度高的紫外光照,即使是微量DNA也可觀測(cè)到。
光強(qiáng)度可調(diào):10%-99%自由調(diào)節(jié)。
操作方便:能以任意角度調(diào)節(jié)紫外防護(hù)板,使觀測(cè)和切膠更方便。
安全設(shè)計(jì):透明紫外防護(hù)板,可保護(hù)實(shí)驗(yàn)人員免于紫外線的傷害。
散熱設(shè)計(jì):內(nèi)含風(fēng)扇冷卻裝置幫助散熱。
下圖是析浦紫外透射臺(tái)XEPU-1126
析浦雙LED藍(lán)白光透射儀XEPU-1126B,又稱藍(lán)光切膠儀、藍(lán)光透射臺(tái)或藍(lán)白光透射儀??捎糜诤怂幔―NA/RNA)凝膠電泳的觀察和切膠,適用于新型無(wú)毒DNA染料,避免了溴化乙錠染料對(duì)人體的傷害,同時(shí)大大降低了紫外線對(duì)樣本的損傷。一鍵切換藍(lán)白光源,操作簡(jiǎn)單,一機(jī)多用!是您的切膠好助手!
藍(lán)光LED:適用于熒光染色的核酸和蛋白質(zhì)凝膠 (fluorescently stained nucleic acid and protein gels)
白色LED:適用于比色染色的蛋白質(zhì)凝膠和生色染色膜 (colorimetric stained protein gels and chromogenically stained membranes)
下圖是析浦藍(lán)光切膠儀XEPU-1126B